2009 m. AB „Achema" baigė trejų metų trukmės II-ąją investicinę programą, skirtą trąšų gamybos plėtrai, energijos ištekliams taupyti ir aplinkos taršai mažinti. Išlaidos programos įgyvendinimui apie 0,5 mlrd. Lt. Jos etapai:

• 2006 m. liepos mėnesį pradėta eksploatuoti izoterminė amoniako saugykla, lapkričio mėnesį paleistas naujas 1.500 t/parą projektinį pajėgumą turintis modernus amoniako gamybos cechas Nr.2.
• 2007 m. gegužės mėnesį paleistas angliarūgšties gamybos agregatas, kuris padidino šio produkto gamybą 100 t/parą.
• Kadangi plečiant trąšų gamybą didėja azoto rūgšties poreikis, 2008m. rugsėjo mėnesį pradėta naujo azoto rūgšties agregato eksploatacija, padidinusi azoto rūgšties gamybą 350 t/ parą.
• 2009 m. birželio mėnesį paleistas 1.000 t/parą projektinio pajėgumo karbamido gamybos agregatas Nr.4, tuo tarpu kiti trys karbamido gamybos agregatai kartu gali pagaminti 1.300 t/ parą karbamido.

Atsižvelgiant į vartotojų poreikius mažesnių formalino emisijų dervai, 2008 m. pradėta gaminti melamino karbamido formaldehidinė derva. Iki 2014 m. pabaigos planuojama karbamido formaldehidinių dervų gamybą išplėsti nuo dabartinių 75 tūkst. t/metus iki 200 tūkst. t/metus.

Nuo 2008 m. AB „Achema" kartu su užsienio partneriais vykdo du bendro įgyvendinimo (BĮ) projektus, kurių tikslas - sumažinti azoto oksidų (šiltnamio efektą sukeliančių dujų) emisijų lygmenį iki 2012 m. pabaigos 70-80 %.

Vystant energetikos sektorių, 2011 m. rugsėjo mėnesį pradėta eksploatuoti 47 MW kogeneracinė dujų jėgainė Nr.2. Kartu su nuo 2004 m. veikiančia 21 MW kogeneracine jėgaine Nr.1 ji gali AB „Achema" visiškai aprūpinti elektros energija ir, esant palankioms sąlygoms, dalį elektros energijos tiekti rinkai. Apie 10% lėšų šiam projektui gauta iš ES struktūrinės paramos. Įgyvendinus numatytą projektą AB "Achema" galės sutaupyti beveik 22% pirminės energijos, sumažinti teršalų išmetimą į atmosferą, kadangi ši elektros energija yra daug pigesnė nei pirktinė, be to, labiau tausojanti aplinką.

2011 m. atliktas amoniako cecho Nr.1 rekonstrukcijos I etapas, kuris leido sumažinti gamtinių dujų sunaudojimą amoniako gamybai.

2011 m. pradėtas vystyti investicinis projektas „Naujų skystų ir dujinių produktų gamybos technologijos diegimas AB „Achema"", kuriam skirta ES struktūrinių fondų parama. Įgyvendinus projektą, bus įdiegta nauja oro skaidymo produktų gamybos technologija, leisianti gaminti aukštos kokybės dujinius ir skystus argoną, deguonį ir azotą.